600 Senelik Mumyadan Safra Taşı Kullanılarak Tekrardan Oluşturulan E.Coli Bakterisinin Genomu

E.coli, mühim bir sıhhat problemi olan ve sayısız ölüme neden olan bir bakteri türüdür. Bakteri sıhhatli insan ve hayvanların bağırsaklarında bulunurken, evriminin zamanı bilinmiyor. Şimdi, McMaster Üniversitesi’ndeki araştırmacılar, 16. yüzyıldan kalma bir İtalyan mumyasının safra taşını kullanarak E.coli’nin ilk antik genomunu başarıyla tekrardan yapılandırdılar. E.coli pandemilere yol açmaz ve daha fazlaca kommensal olarak adlandırılır. Bu tür bakteriler vücudumuzun içine girer ve konakçı savunmasız hale vardığında istila etmek için bekler. Çoğu zaman stres, bağışıklık yetmezliği yada hastalık şeklinde durumlarda saldırır. Dünya genelinde ortalama 200 milyon ölüme yol açan Kara Ölüm şeklinde pandemiler iyi belgelenmiştir. Sadece, bakteri insan sağlığını da mühim seviyede etkilemiş olsa bile, E.coli’nin kaybetmiş olduğu hayatlar hakkında mevcut hiçbir tarihsel veri yok. “Geçmişimizde toplu ölümlerin tek anlatısı olarak pandemiye yol açan patojenlere sıkı bir halde odaklanmak, büyük tehlikeyi gözden kaçırıyor. McMaster’ın Antik DNA Merkezi’nin yöneticisi ve üniversitenin Michael G. DeGroote Enfeksiyon Hastalıkları Araştırma Enstitüsü’nün baş araştırmacısı olan evrimsel genetikçi Hendrik Poinar, “Yaşanmış olan yaşamların stresinden meydana gelen fırsatçı ortak ilişkilerden meydana gelen yük” dedi. İletişim Biyolojisi, araştırmacılar, E.coli’nin şimdiye kadarki evrimi hakkında bir düşünce verecek 400 senelik atasını yaratmayı amaçladılar. 1983 senesinde Napoli’deki Saint Domenico Maggiore Manastırı’ndan çıkarılan bir grup İtalyan soylusunun mumyalanmış bedenlerinden parçalar kullandılar. Ekip, 1586’da 48 yaşlarında öldüğüne inanılan soylulardan birinin mumyasını çözümleme etti. Araştırmacılar ek olarak kişinin safra kesesi taşı taşıdığını ve bundan dolayı safra kesesinde kronik iltihaplanma bulunduğunu kaydetti. Çiçek hastalığı şeklinde bir enfeksiyonun aksine, fizyolojik göstergeler yoktur. McMaster’da biyoinformatik lisansüstü talebesi olan George Long, “Kimse bunun ne işe yaradığını bilmiyordu” dedi. Long bununla birlikte çalışmanın baş yazarıdır ve mumyanın analizini yürütmüştür. Araştırmacılar bakterinin parçalarını vücuttan izole etti ve materyali genomu geliştirmek için kullandı. Bununla, genomun işlevlerini anlayabildiler ve şimdi bu tür gizli saklı patojenleri arayan öteki araştırmacılara yardım etmeyi umuyorlar. E.coli’nin bir çok formu, bağırsaklarında yaşarken konakçıları için çekince oluşturmaz. Sadece bazı suşların ölümcül besin zehirlenmesi salgınlarına ve kan dolaşımı enfeksiyonlarına bile niçin olduğu bulunmuştur. Ek olarak, E.coli uyarlanabilir, bu da onu tedavilere karşı dirençli kılar.

Teknoloji Haberleri